著名环保团体世界自然基金会在其一份针对全球海水淡化厂的评论中称，淡化海水已成为一种制水新趋势，但会对环境构成潜在的祸害，而且还会加剧全球气候变暖。
　　世界自然基金会的这篇评论名为《制水：脱盐——对焦渴的世界是选择还是困惑？》。评论指出，RO膜在污水提炼纯净水和回用方面已取得相当成功的成绩和经验，除此以外，RO膜亦广泛应用于海水淡化。“在印度，RO膜应用有限，主要用于去除农村饮用水里的污染物。其实，光从人道主义的角度来看，RO膜也应该得到更广的应用。”评论宣称，“RO膜在提高水使用效率方面潜力巨大，比如通过再循环再用处理污水、废水，净化和修复水环境，比如还水湿地，加强水流，给地下蓄水层补水。”
　　评论显示，目前世界上最干旱和焦渴的部分地区都开始采用海水淡化。而且这些地区都是一些人口稠密地区，比如澳大利亚、中东、西班牙、英国和美国，而印度和中国的海水淡化业正在加快发展。据透露，澳大利亚的帕斯打算利用海水来保障1/3的淡水供应；西班牙的淡化海水几乎都用于农业灌溉，22%的比率在全世界居第一位，此外就是干旱地区的度假村屋。“海水淡化是一种昂贵的、耗能、会造成温室效应的制水方式。”世界　　自然基金会全球淡水计划负责人杰米·彼托如此说道。“海水淡化可能仍可以在未来淡水供应上占一席位，但可以采用更经济、效果更好、更相配的制水方式的地区最好少给大自然造成更多的危害。”
海水淡化的影响包括浓盐水集结、加剧温室效应、破坏珍贵的海岸线地区和分薄对江河、湿地的保护。海水淡化应用最多的地区很多都有破坏天然水资源尤其是地下水的前科。
　　如何平衡对淡水的需求和估算任何一个大型制水工程都必须事前做足功课，以免对大自然作成不可逆转的损害，而且从此产生的庞大费用最终会摊分到广大老百姓身上。可持续的水资源从保护天然的资产比如江河、湿原、湿地做起。这些资源不但净化和供应水，还避免异常或灾难性的事件发生。
　　“大型的海水淡化工程可能很快变成‘新的大坝’，掩盖了切实保护江河和湿地的重要性。就像上世纪50年代后上马的大坝那样，其负面性一早就得知，以免太晚或花费太多来弥补损害。而我们现在最需要的是对水采取一种新的态度，而不是不加调查的制水工程的随意上马。”彼托说道。